线型UP分子中，每个分子链含有大约十几个不饱和链节，这些不饱和链节通过自由基，引发与乙烯基单体发生交联、据报导，线型聚酯分子链中的不饱和链结的分布影响着固化过程的动力学，并终影响着固化的UPR树脂的内在性能。由于三维网络中空间位阻的原因，相互接近的不饱和双键的链段可能具有较低的固化反应活性，因此当聚酯分子中不饱和链节分布较集中时，所得树脂具有较低反应活性，其制品具有较低的机械性能。
(4)分子结构中双键的顺反结构
不饱和聚酯树脂通过分子链中的不饱和双键与乙烯基单体（如苯乙烯）交联。在缩聚反应阶段，一部分双键的顺式结构（马来酸酯）会随着反应的进行而异构化为反式（富马酸酯）结构：
在聚酯分子链中，反式结构含量越高，树脂的固化反应活性越高，终制品的机械性能指标越高。这是由于在树脂固化过程中，反式结构的双键除了与苯乙烯共聚交联外，自身也可以发生自聚反应，提高了交联反应密度，因而提高了树脂产品的终性能。一般可通过提高反应温度、加入催化剂、改善合成工艺等方法来提高分子结构中反式结构的比例。
3.合成工艺
如前所述，在合成不饱和聚酯树脂过程中，不同的合成反应工艺条件会改变聚酯分子的分子量大小、分子量分布、分子结构的排布顺序等，从而影响终产品的内在性能。不同的合成工艺条件包括投料顺序、反应步骤、升温速度、反应温度、催化剂、惰性气体等。一些性能优异的树脂往往可以通过调节合成工艺来获得。例如可使树脂在配方不变也就是原料成本不变的前提下，通过采用不同的合成工艺，达到改变分子结构，从而提高树脂内在性能的目的。
